Al joc Pixel Samurai, hauràs d'ajudar un samurai valent a lluitar contra bandes de delinqüents. Davant teu a la pantalla serà visible el teu personatge, que anirà córrer per la carretera agafant velocitat gradualment. En el camí de l'heroi hi haurà diversos tipus d'obstacles i trampes que el samurai haurà de superar a tots. Després d'haver trobat oponents, el teu samurai haurà de colpejar a la carrera amb una espasa i així destruir tots els oponents que es trobin.